氣相色譜儀經常用于有機物的定量分析，儀器在運行一段時間后，由于靜電原因，儀器內部容易吸附較多的灰塵;電路板及電路板插口除吸附有積塵外，還經常和某些有機蒸氣吸附在一起等各種情況經常發生。
氣相色譜儀內部的吹掃、清潔
氣相色譜儀停機后，打開儀器的側面和后面面板，用儀表空氣或氮氣對儀器內部灰塵進行吹掃，對積塵較多或不容易吹掃的地方用軟毛刷配合處理。吹掃完成后，對儀器內部存在有機物污染的地方用水或有機溶劑進行擦洗，對水溶性有機物可以先用水進行擦拭，對不能*清潔的地方可以再用有機溶劑進行處理，對非水溶性或可能與水發生化學反應的有機物用不與之發生反應的有機溶劑進行清潔，如甲苯、丙酮、四氯化碳等。注意，在擦拭儀器過程中不能對儀器表面或其他部件造成腐蝕或二次污染。