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過流式紫外線殺菌器一般適用于中、小水量處理或有必要施加壓力且消毒器不能在明渠中使用的情況。紫外線殺菌有高效、廣譜、無二次污染、運行安全可靠、占地面積小、初投資小，能夠實現連續大水量消毒。
紫外線殺菌有高效、廣譜、無二次污染、運行安全可靠、占地面積小、初投資小，能夠實現連續大水量消毒。紫外線對水中細菌、病毒具有較強的滅活能力，滅菌率一般可達 99.99%；紫外線殺菌技術有較高的殺菌效率，當紫外線輻射強度為3000μW/平方cm，對細菌病毒的殺菌作用一般都在1s之內，所需時間僅是一般化學法的1/600～1/10，紫外線殺菌特征就是大水量消毒、連續運行。影響紫外線殺菌效果的主要因素有紫外線的波長、照射強度及時間，并與水的深度、色度、濁度、微生物的類型和數量等有關。
根據生物效應的不同，將紫外線按照波長劃分為四個部分：A波段(UV—A)，又稱為黑斑效應紫外線(400～320nm)；B波段(UV—B)，又稱為紅斑效應紫外線(320～275nm)；C波段(UV—C)，又稱為滅菌紫外線(275～200nm)；D波段(UV—D)，又稱為真空紫外線(200～10nm)。水消毒主要采用的是C波段紫外線。
研究表明，紫外線主要是通過對微生物細菌、病毒、芽孢等病原體的輻射，損傷和破壞核酸的功能使微生物致死，從而達到殺菌消毒的目的。紫外線對核酸的作用可導致鍵和鏈的斷裂、股間交聯和形成光化產物等，從而改變了DNA的生物活性，使微生物自身不能復制，這種紫外線損傷也是致死性損傷。
通常，水殺菌消毒用的紫外線燈的中心輻射波長是 253.7nm（C波段200nm～275nm。紫外線的殺菌效果取決于紫外線的輻射強度和照射時間的乘積，即輻照劑量。
輻照劑量 ＝ 輻射強度 × 照射時間
過流式紫外線殺菌器筒體常用不銹鋼制造，內壁作拋光處理以提高對紫外線的反射能力和增強輻射強度，還可根據處理水量的大小調整紫外燈的數量。紫外線燈管外罩密封石英套管。
過流式紫外線殺菌器一般適用于中、小水量處理或有必要施加壓力且消毒器不能在明渠中使用的情況。
而浸沒式紫外線殺菌器適用于中、大水量處理，多用于污水處理廠。
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