滬鼎生物|蛋白質糖基化位點檢測實驗步驟

蛋白質糖基化位點檢測：用酶或化學脫糖基化、通過選擇性標記或通過凝集素親和層析法是檢測蛋白糖基化常用方法。

一、用 PNGaseF（N-多糖酶）處理。

1. 以 0.1 mol/L 磷酸鈉（或 Tris-HCl，而不用檸檬酸）緩沖液，pH 7.4 ( 7.0~8.0 ) 配制高達 2 mg/ml 的蛋白溶液，并含 50 mmol/L β-巰基乙醇和 0.1% SDS，在水浴中煮沸 2 分鐘。

2. 加 1/10 體積的 10% NP-40 溶液（或使 SDS 濃度少于或等于 0.17%，NP-40：SDS 的質量比在終反應中至少是 7:1)。

3. 加 PNGaseF 到終濃度為 6 mU/ml。注意這里的 1U 相當于在 1 分鐘形成的 1 微摩爾產物；一些廠家用 1U = 1 nmole/分 在 37℃ 中保溫 16 小時，以wan全脫糖基化。

4. 用 TCA/DOC 按照下列步驟沉淀以制備 SDS-PAGE 樣品。

(1) 在樣品中加等體積的含 50% TCA 的 10 mmol/L DOC 溶液，并且在冰上放置 20 分鐘。

(2) 以最大速度（16000 g)，4℃ 下離心樣品 15 分鐘。

(3) 用冷丙酮清洗沉淀一次，并再次離心樣品。

(4) 用 SDS-PAGE 樣本緩沖液重懸最后的沉淀，如有必要，可用小體積的 1 mol/L Tris pH 8.0。將懸液調至 pH 8.0 樣品上樣至凝膠上進行電泳。

二、用 EndoH 處理

1. 在 100 mmol/L、pH 5.5 的檸檬酸鈉緩沖液中制備濃度達到 1 mg/ml 的蛋白樣品。

2. 用 10 mU/ml 酶 37℃ 消化樣品過夜。

3. 按常規的方法處理樣品用于 SDS-PAGE 分析。

三、酶去除 O -多糖

1. 二甲胂酸鈉（磷酸鹽或馬來酸鹽，但不是 Tris-HCl ) 中制備濃度 5 mg/ml 的蛋白，pH 6~7.6。

2. 用 10 mU/ml 的酶消化樣品，在 37℃ 孵育過夜。

3. 按照 PNGaseF 第 4 步所述的方法（TCA/DOC 沉淀）處理反應混合物以進行 SDS-PAGE。

四、來自產脲節桿菌的唾液酸苷酶

1. 以 pH 5.0、50 mmol/L 醋酸鈉制備 0.5 mg/ml 的蛋白溶液。

2. 加 10 mU/ml 的唾液酸苷酶，37℃ 下保溫 12~16 小時。

3. 制備樣品用于 SDS-PAGE 分析。

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