【儀表網(wǎng) 儀表研發(fā)】單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)是一種在單細(xì)胞水平上對(duì)基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組等進(jìn)行高通量測(cè)序分析的技術(shù)。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)能夠在組學(xué)水平揭示細(xì)胞間的異質(zhì)性。單細(xì)胞水平細(xì)胞譜系追蹤技術(shù)位居2018年Science 雜志評(píng)選的科學(xué)突破。常規(guī)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)丟失了細(xì)胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息，而單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的同時(shí)保留并記錄了細(xì)胞的空間位置信息。空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細(xì)胞間的相互作用以及細(xì)胞所處的微環(huán)境，將成為發(fā)育生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)、腫瘤微環(huán)境等領(lǐng)域的研究利器。
11月12日，《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發(fā)表了中國科學(xué)院生物物理研究所高通量測(cè)序中心題目為SpatialDB: a database for spatially resolved transcriptomes 的論文，發(fā)布個(gè)單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫及數(shù)據(jù)在線可視化平臺(tái)。SpatialDB系統(tǒng)收錄了來自5個(gè)物種由8種空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，建立了空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析處理流程，實(shí)現(xiàn)了空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的在線可視化，同時(shí)提供了空間差異表達(dá)基因及其功能富集分析的注釋。
中科院院士、生物物理所研究員陳潤生以及工程師陳小偉為論文共同通訊作者。生物物理所高通量測(cè)序中心工程師范珍為論文作者。該研究獲得中科院關(guān)鍵技術(shù)人才項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金和國家重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目的資助。
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