化合物鑒定效率低下在中藥研發過程一直是個難題，想要使鑒定效果*，除了需要的儀器設備之外，如能有個涵蓋全面、高精質量的數據庫掌握在手，是否能夠成為研發人員的福音呢？請看賽默飛如何攜手清華大學實現這一點：

研究背景

隨著質譜技術的不斷發展，尤其是利用高分辨質譜能夠準確獲取待測物質荷比，適用于復雜樣品中多種化合物的同時高選擇性分析，具有檢測靈敏度高、動態范圍寬的特點，因此，其在化合物定性研究領域越來越受到廣大學者歡迎。需要注意的是，雖然通過高分辨質譜技術，可以直接觀測到化合物的保留時間、質荷比、同位素分布和碎片離子信息，但是在進行結構推導時需利用大量文獻檢索和分析人員的經驗才能完成，導致化合物鑒定效率低下。

為了解決質譜結構推導問題，幫助研究人員快速準確鑒定中藥成分，賽默飛世爾科技與清華大學藥學院藥物發現平臺合作，以《中國藥典》2015年版（一部）收錄的中藥材為參考，利用Thermo Scientific靜電場軌道阱 (Orbitrap) 高分辨質譜平臺，采用特定的色譜-質譜采集方法，完成了1200余種中藥化合物對照品的一級和碎片質譜圖采集，獲得了7千多張目前市面上zui高質量的二級質譜圖。可實現中藥及天然產物成分的快速準確表征。
 

01賽默飛中藥高分辨數據庫簡介

數據庫收載化合物來源于將近430種常見植物的藥、動物藥、瀕危物種和藥食同源物種，涵蓋所有常見的中藥成分類型，如苯丙素、醌、黃酮、萜、甾體、生物堿、酚酸和其他類等。

在數據處理軟件TraceFinder和Compound Discoverer (CD) 的幫助下，根據化合物的保留時間、不同加和離子的質荷比、同位素豐度、碎片離子等信息可對原始數據進行數據庫檢索并綜合打分，從而快速鑒定化合物的結構。

該數據庫的優勢在于：

①采用特定數據采集系統，獲得相對固定的化合物保留時間，可為鑒定化合物同分異構體提供幫助；

②Orbitrap高分辨質譜儀具有分辨率高、質量精度高、穩定性好等特點，有力保障了數據庫譜圖質量；

③添加了常見的植物基源，可對特定中藥的成分進行快速篩選；

④各化合物均添加了CAS ID 、ChemSpider ID 和PubChem ID ，可以鏈接至相應做結構查找。

02樣品采集系統

本數據庫基于超液相色譜-靜電場軌道阱高分辨質譜 (UHPLC-Orbitrap HRMS) 平臺。可適用于Q Exactive系列、Fusion系列高分辨質譜所采集的數據檢索。

03數據庫界面展示

本數據庫分別基于TraceFinder軟件和譜圖管理軟件mzVault進行搭建，得到可用于高通量快速篩查的Database和可用于實際譜圖匹配的Spectral Library。

圖1 基于TraceFinder軟件平臺的Database界面

圖2 基于mzVault軟件平臺的Spectral Library界面

04數據庫應用領域

該高分辨數據庫結合Thermo Scientific已有的在線高分辨數據庫mzCloud，使得賽默飛在中藥成分鑒定、有害殘留控制和植物代謝組學等研究領域的解決方案更加完善。

圖3 賽默飛中藥成分鑒定解決方案

圖4 賽默飛植物代謝組學解決方案

特別鳴謝

OTCML數據庫凝聚了清華大學藥學院藥物發現平臺各位老師的傾情奉獻與汗水，特此鳴謝為該數據庫做出貢獻的科學家們：

丁怡：教授，清華大學藥學院藥物發現平臺主管；

侯朋藝：博士，賽默飛世爾科技生命科學質譜應用專家；

艾靜雅：清華大學藥學院藥物發現平臺質譜應用工程師；

龐歡歡：清華大學藥學院博士后；

其他參與數據庫建立工作人員：宋詞（清華大學藥學院）

更多詳情，請關注“賽默飛色譜與質譜中國”公眾號。