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    蝦白尾病(WTD)熒光 RT-PCR 檢測試劑盒(XSV)說明書

    閱讀:134發(fā)布時間:2018-01-18

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    1、 蝦白尾病(WTD)熒光 RT-PCR 檢測試劑盒(XSV)簡介 
    貨號:HB-810-2 
    蝦白尾病(White tail disease,WTD)也稱為白肌肉病(White muscle disease,WMD)或羅
    氏沼蝦肌肉白濁病(Macrobrachium rosenbergii Whitish muscle disease),主要在亞洲和南美洲
    北部流行。其主要病原為羅氏沼蝦野田村病毒(Macrobrachium rosenbergii Nodavirus,MrNV),
    研究發(fā)現(xiàn)感染對蝦中還存在另外一種超小型病毒(Extra small virus,XSV),為 MrNV 的微型病毒。
    蝦感染后腹部、尾部出現(xiàn)白色渾濁,zui終可擴(kuò)散全身肌肉,死亡率可達(dá) 95%以上。
    為了適應(yīng)蝦白尾病快速檢測和疫病研究的需要,本公司參考 2016 年 OIE 水生動物疾病診斷手冊
    2.2.7 中*的的引物和探針序列,經(jīng)多次實(shí)驗(yàn)及系統(tǒng)優(yōu)化,開發(fā)生產(chǎn)了本試劑盒。應(yīng)用本試劑盒
    進(jìn)行檢測具有快速、靈敏、特異、準(zhǔn)確、安全操作簡單、應(yīng)用廣泛和高通量檢測等特點(diǎn)及優(yōu)點(diǎn)。
    2、 試劑盒組成 
    試劑盒組成包括核酸擴(kuò)增試劑。具體組成參見表 1:
    表 1:試劑盒組成(50test/盒)
    試劑盒組成成分 體積 
    *: 核酸裂解液 15ml×2 管
    核酸擴(kuò)增試劑: DEPC 水
    WTD-XSV熒光RT-PCR反應(yīng)液
    酶混合物
    陰性對照
    WTD-XSV 熒光陽性對照
    1ml×1 管
    750µL×1 管
    60µL×1 管
    1ml×1 管
    1ml×1 管
    (注:*可使用本公司生產(chǎn)的提取核酸更快捷方便的《病毒 RNA 柱式提取試劑盒》) 
    3、 樣本采集,存放及運(yùn)輸 
    3.1 樣本采集:所用取樣器材必須經(jīng)高壓滅菌并烘干。隨機(jī)取5只-10只新鮮的蝦作為采樣標(biāo)本,采
    集的部位包括:蝦頭部的眼柄、肝胰腺、頭腹部肌肉或腹肢等(可部分或全部采集這些組織)。詳
    見相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)。
    3.2 存放:研磨后的樣本在 2 ℃—8 ℃條件下保存應(yīng)不超過 24 h;-70 ℃以下可*保存,但應(yīng)避
    免反復(fù)凍融(zui多凍融 3 次)。
    3.3 運(yùn)輸:采用泡沫箱加冰密封進(jìn)行運(yùn)輸。
    4、 熒光 RT-PCR 檢測 
    4.1 操作方法 
    4.1.1 樣本的處理(在樣本制備區(qū)進(jìn)行):
    4.1.1.1 取 n 個滅菌的 1.5 mL Eppendorf 管,其中 n 為被檢樣品與陰性對照的和(陽性對照、陰性對照在試劑盒中已標(biāo)出),做標(biāo)記。(注:試劑盒中的陽性對照直接作為 PCR 檢測的模板,無需
    提取核酸)
    4.1.1.2 蝦白尾病(WTD)熒光 RT-PCR 檢測試劑盒(XSV)每管加入 600 ?L 裂解液,分別加入被檢樣本和陰性對照各 200 ?L,一份樣本換用一個吸頭,混勻器上振蕩混勻 5 s(不能過于強(qiáng)烈,以免產(chǎn)生乳化層,也可以用
    手顛倒混勻),于 4℃ 12 000 r/min 離心 15 min。
    4.1.1.3 取與 4.1.1.1 相同數(shù)量滅菌的 1.5 mL Eppendorf 管,加入 500 ?L 異丙醇(-20℃預(yù)冷),
    做標(biāo)記。吸取 4.1.1.2 各管中的上清液轉(zhuǎn)移至相應(yīng)的管中,上清液應(yīng)至少吸取 500?L,不能吸
    出中間層,顛倒混勻。
    4.1.1.4 于 4 ℃、12 000 r/min 離心 15 min(Eppendorf 管開口保持朝離心機(jī)轉(zhuǎn)軸方向放置),小
    心倒去上清,倒置于吸水紙上,沾干液體(不同樣品須在吸水紙不同地方沾干);加入 600 ?L 75%
    乙醇,顛倒洗滌。
    4.1.1.5 于 4 ℃、12 000 r/min 離心 10 min(Eppendorf 管開口保持朝離心機(jī)轉(zhuǎn)軸方向放置),小
    心倒去上清,倒置于吸水紙上,盡量沾干液體(不同樣品須在吸水紙不同地方沾干)。
    4.1.1.6 4 000 r/min 離心 10s(Eppendorf 管開口保持朝離心機(jī)轉(zhuǎn)軸方向放置),將管壁上的殘余
    液體甩到管底部,小心倒去上清,用微量加樣器將其吸干,一份樣本換用一個吸頭,吸頭不要
    碰到有沉淀一面,室溫干燥 3 min,不能過于干燥,以免 RNA 不溶。
    4.1.1.7 加入 11 ?L DEPC 水,輕輕混勻,溶解管壁上的 RNA,2 000 r/min 離心 5 s,冰上保存?zhèn)?br />用。提取的 RNA 須在 2 h 內(nèi)進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增;若需*保存須放置-70 ℃冰箱內(nèi)。
    【也可參照《病毒 RNA 柱式提取試劑盒說明書》(貨號:HB-QPCR-01)使用,更方便快捷提取
    核酸】。
    注:提取的 RNA 須在 2 h 內(nèi)進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增;若需*保存須放置-70 ℃冰箱內(nèi)。 
    4.1.2 檢測
    4.1.2.1 擴(kuò)增試劑準(zhǔn)備(在反應(yīng)混合物配制區(qū)進(jìn)行):
    從試劑盒中取出相應(yīng)的熒光 RT-PCR 反應(yīng)液、酶混合物,在室溫下融化后,2000 r/min 離心 5 s。
    設(shè)所需熒光 RT-PCR 檢測總數(shù)為 n,其中 n 為被檢樣品、陽性對照與陰性對照的和,每個樣品測試反
    應(yīng)體系配制見表 2:
    表 2 每個樣品測試反應(yīng)體系配制表
    試劑 RT-PCR 反應(yīng)液 酶混合物
    用量 15 μL 1.0 μL
    根據(jù)測試樣品的數(shù)量計(jì)算好各試劑的使用量,加入到適當(dāng)體積試管中,充分混合均勻,向每個
    熒光RT-PCR管中各分裝16 ?L,轉(zhuǎn)移至樣本處理區(qū)。
    4.1.2.2 加樣(樣本處理區(qū)進(jìn)行):
    在各設(shè)定的熒光RT-PCR管中分別加入上述樣本處理步驟4.1.1.7中制備的RNA溶液各10 ?L,蓋緊
    管蓋,500 r/min離心30 s。
    4.1.2.3 熒光 RT-PCR 檢測(在檢測區(qū)進(jìn)行):
    將4.1.2.2中離心后的PCR管放入熒光RT-PCR檢測儀內(nèi),記錄樣本擺放順序。
    循環(huán)條件設(shè)置:
    *階段:42oC /60 min;
    第二階段:95oC /10 min;
    第三階段:95oC /15 sec, 58 oC /30 sec,40個循環(huán),在58 o
    C的退火延伸時收集熒光。
    試驗(yàn)檢測結(jié)束后,根據(jù)收集的熒光曲線和Ct值判定結(jié)果。
    注:本試劑盒采用Eva Green熒光染料標(biāo)記,熒光波長與SYBR Green相近,進(jìn)行檢測時選取SYBR Green染料法即可! 
    4.2 結(jié)果判定 
    4.2.1 結(jié)果分析條件設(shè)定
    直接讀取檢測結(jié)果。閾值設(shè)定原則根據(jù)儀器噪聲情況進(jìn)行調(diào)整,以閾值線剛好超過正常陰性樣
    品擴(kuò)增曲線的zui高點(diǎn)為準(zhǔn)。
    4.2.2 質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
    4.2.2.1 陰性對照無 Ct 值或無擴(kuò)增曲線。
    4.2.2.2 陽性對照的 Ct 值應(yīng)<25.0,并出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線。否則,此次實(shí)驗(yàn)視為無效。
    4.2.3 結(jié)果描述及判定
    4.2.3.1 陰性
    無Ct值或無擴(kuò)增曲線,示樣品中無待檢病原核酸。
    4.2.3.2 陽性
    Ct值≤30,且出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,示樣品中存在待檢病原核酸。
    4.2.3.3 蝦白尾病(WTD)熒光 RT-PCR 檢測試劑盒(XSV)有效原則
    Ct值>30的樣本建議重做。重做結(jié)果無數(shù)值者或仍大于30為陰性,否則為陽性。


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