蒸餾水器按照制作材質進行區分：不銹鋼蒸餾水器和玻璃蒸餾水器二種

不銹鋼蒸餾水器有普通不銹鋼蒸餾水器和塔式蒸餾水器。一般蒸餾水器就是傳統的不銹鋼蒸餾水器。塔式的一般要連接鍋爐利用鍋爐的蒸汽來制蒸餾水，一般體型也較大，出水量是很大的。

石英玻璃蒸餾水器可分為普通的玻璃蒸餾水器（一般只有蒸發鍋是石英的），和石英（亞沸）蒸餾水器，石英（亞沸）蒸餾水器是利用紅外線輻射的，在低于水的沸點的情況下使水蒸發的，可以避免傳統電熱加熱煮沸使水蒸汽中含有其他雜質，也可避免與水共沸的雜質混入成水中。但是石英蒸餾水器由于材質問題易碎且體型較小，紅外線加熱緩慢，因此其產水量不是很高，一般亞沸的Z多的1500ML/H。因此產出水水質比普通不銹鋼蒸餾器要高很多。