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    急性肝胰腺壞死(AHPND)熒光 PCR 檢測試劑盒說明書

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      上海谷研實業(yè)有限公司
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    1、 急性肝胰腺壞死(AHPND)熒光PCR檢測試劑盒簡介 
    貨號:HB-809-3 
    為了適應(yīng)蝦急性肝胰腺壞死(AHPND)快速檢測和疫病研究的需要,本公司根據(jù) OIE 手冊中提供的
    參考序列和信息并在其基礎(chǔ)上優(yōu)化改進,開發(fā)生產(chǎn)了本試劑盒。應(yīng)用本試劑盒進行檢測具有快速、
    靈敏、特異、準確、安全操作簡單、應(yīng)用廣泛和高通量檢測等特點及優(yōu)點。
    2、試劑盒組成 
    試劑盒組成包括核酸提取試劑和核酸擴增試劑,具體組成參見表 1:
    表 1:試劑盒組成(50test/盒)
    組成成分 體積
    樣品 DNA 提取液 1
    樣品 DNA 提取液 2
    5ml×1 管
    500µl×1 管
    核酸擴增試劑: DEPC 水
    AHPND 熒光 PCR 反應(yīng)液
    Taq 酶(5U/ul)
    陰性對照
    AHPND 熒光陽性對照
    5ml×1 管
    750µl×1 管
    40µl×1 管
    1ml×1 管
    1ml×1 管
    *保存條件:樣品 DNA 提取液 1、2 和試劑盒須在-20℃保存。 
    3、樣本采集,存放及運輸 
    3.1 樣本采集:所用取樣器材必須經(jīng)高壓滅菌并烘干。取組織標記后置于離心管中,按照試劑盒配套的DNA 抽提試劑操作說明提取DNA模板。
    3.2存放:研磨后的樣本在2 ℃-8 ℃條件下保存應(yīng)不超過24 h;-70 ℃以下可長期保存,但應(yīng)避免反復凍融(多凍融3次)。
    3.3 運輸:采用泡沫箱加冰密封進行運輸。 
    4、檢測步驟 
    4.1 DNA 核酸提取操作方法(在樣本處理區(qū)進行): 
    4.1.1 取 n 個 1.5ml 滅菌 Eppendorf 管,其中 n 為待檢樣品數(shù)和一管陰性對照之和,對每個管進行編號標記。(注:試劑盒中的陽性對照直接作為 PCR 檢測的模板,無需提取核酸)
    4.1.2 每管加入 100 µl DNA 提取液 1,然后分別加入待測樣本和陰性對照各 100µl,一份樣本換用一個吸頭;混勻器上震蕩混勻 5 s,于 4℃~25℃條件下,12 000 r/min 離心 10 min。
    4.1.3 盡可能吸棄上清且不碰沉淀,再加入 10µl DNA 提取液 2,混勻器上震蕩混勻 5s,于 4℃~25℃條件下,2 000 r/min 離心 10 s。
    4.1.4 100℃ 干浴或沸水浴 10 min;加入 90µl DEPC 水,12 000 r/min 離心 10 min,吸取上清,
    即為提取的 DNA,冰上保存待用(提取的 DNA 需在 2 h 內(nèi)進行 PCR 擴增或放置于-70℃冰箱內(nèi)保存)。
    4.2 熒光 PCR 檢測 
    4.2.1 急性肝胰腺壞死(AHPND)熒光PCR檢測試劑盒擴增試劑準備(在反應(yīng)混合物配制區(qū)進行):
    從試劑盒中取出相應(yīng)的熒光 PCR 反應(yīng)液、Taq 酶,2000×g 離心 5 秒鐘。每個樣品測試反應(yīng)體系
    配制見下表 2。
    表 2 每個樣品測試反應(yīng)體系配制表
    試劑 熒光 PCR 反應(yīng)液 Taq 酶 合計
    用量 14.5 μL 0.5μL 15μL
    4.2.2 加樣(樣本處理區(qū)進行):
    向每個熒光 PCR 管孔中各分裝 15μL 的混合液,再分別加入樣本 DNA 模板 10μL,蓋緊管蓋,
    500 r/min 離心 30 s。
    4.2.3 PCR 檢測(在檢測區(qū)進行):
    循環(huán)條件設(shè)置:
    *階段,95℃/3 min;
    第二階段,95℃/15 sec,60℃/1 min,40 個循環(huán);在第二階段每次循環(huán)的退火延伸時收集熒
    光。試驗檢測結(jié)束后,根據(jù)收集的熒光曲線和 Ct 值判定結(jié)果。
    5、結(jié)果判定 
    5.1 結(jié)果分析條件設(shè)定
    直接讀取檢測結(jié)果。閾值設(shè)定原則根據(jù)儀器噪聲情況進行調(diào)整,以閾值線剛好超過正常陰性樣
    品擴增曲線的高點為準。
    5.2 質(zhì)控標準
    5.2.1 陰性對照無 Ct 值或無擴增曲線。
    5.2.2 陽性對照的 Ct 值應(yīng)<25.0,并出現(xiàn)典型的擴增曲線。否則,此次實驗視為無效。
    5.3 結(jié)果描述及判定
    5.3.1 陰性:無Ct值或無擴增曲線,示樣品中無AHPND核酸。
    5.3.2 陽性:Ct值≤30,且出現(xiàn)典型的擴增曲線,示樣品中存在AHPND核酸。
    5.3.3 有效原則:Ct>30的樣本建議重做。重做結(jié)果無數(shù)值者為陰性,否則為陽性。
    6、急性肝胰腺壞死(AHPND)熒光PCR檢測試劑盒相關(guān)技術(shù)信息 
    F:TTGGACTGTCGAACCAAACG
    R:GCACCCCATTGGTATTGAATG
    probe: 5’-FAM-AGACAGCAAACATACACCTATCATCCCGGA-TAMRA-3’

     

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