使用蒸餾水器先將放水閥關閉。開啟水源閥，使自來水進入冷卻器再從回水管入漏斗，然后注入蒸發鍋。直至水位上升到玻璃水位表中心處，待水從益水管流出且水位停止上升時，可暫時將水源閥關閉。接能電源，等到鍋內的水位已沸騰，并開始出蒸氣時，再開啟水閥，但應注意水流不已過大或過小，一般可用手測冷卻器外殼之底部溫度感到微溫(約40度左右)，效果*。蒸餾水出水皮管不易過長，并切忽插入蒸餾水容器中，皮管在使用前應用蒸餾水洗涮潔凈，并保持管路暢通以防止滯塞蒸氣而造成漏水溢水。如需維護自行更換電熱管時，接頭處墊圈必須墊襯好，確保不漏水。否則會造成電熱管的頭部因附著水滴面在通電時給絕緣擊穿，各線頭連接處要將螺絲旋緊，以免通電時產生火花，燒壞電熱管頭部。
供電電源須與產品使用電源要求相一致。在使用本產品時必須選用大于或等于加熱回路電流要求的電源配線，并在入電源前端加裝電路保護裝置，確保操作者的人身安全和電路安全，蒸餾水器的外殼必須接通接地保護線。
使用時應放置在固定的平臺上，平臺放置在有上、下水管道的地方，平臺高度一般在750 mm左右。使用前一定要先加水，后通電。在使用中不得關閉冷卻水。必須注意經常觀察蒸發桶內的水位，水位必須保持在水位鏡可以看到的位置。使用中操作者不得離開。工作結束后或遇到停電時，操作者必須關閉電源。
在新使用時要經過預蒸處理，去除因加工原因而產生的不符合水質要求的蒸餾水。有嚴格水質要求時，還要將蒸餾水經化驗合格后方可使用。
