微孔濾膜的主要功能是從氣相或者液相中截留微粒，細菌及其他雜質，以達到分離，凈化，提純的目的。因此選擇濾膜要考慮以下幾個因素：
1.濾膜的材質（化學兼容性）：選擇濾膜時，首先要考慮化學相容性。濾器是否耐酸、堿、有機溶劑等。具體參見濾膜化學相容性表。
2.濾膜的孔徑：根據需要過濾的分子或顆粒的大小來確定正確范圍的濾膜孔徑。
3.樣品的特性：
1）親水性樣品：選用親水膜片。對水有親和力，適合過濾水為基質的溶液。可用的濾膜有：混合纖維素膜，聚醚砜（PEsM）,NylonM等。
2）強腐蝕性有機溶劑：一般采用疏水性膜。如PTFEM，聚丙烯（PPM）等材質的濾膜
3）蛋白溶液：選擇低蛋白吸附的濾膜，如PVDF濾膜。
4）離子色譜：通常認為PEs濾膜比較適合低無機離子的溶液的過濾。
4、kenker membranes快速選擇表（Since different elements in terms of impact, the data for reference only）
溶 液 | 水溶液及水過濾 | CNM、NylonM 、CAM、MCEM |
組織培養基 | NylonM、HydrophilicPVDFM，PESM |
藥液過濾、飲料過濾 | NylonM 、PESM |
普通微生物學 | CNM |
試劑的無菌處理 | HydrophilicPVDFM |
水質污染指數測定 | MCEM |
藥物除菌除微粒及微粒分析測定 | MCEM |
醫藥行業生物和血清的過濾、大輸液抗菌素等終端過濾 | PESM |
常規過濾低蛋白吸附 | CAM、PVDFM、PESM |
超純水終端過濾 | PESM |
醇溶液 | CAM |
混合物 | NylonM、PTFEM |
離子色譜 | PESM |
溶 劑 | 非極性（疏水性） | PTFEM |
極性（親水性） | NylonM 、HydrophilicPVDFM |
強腐蝕性有機溶劑 | PTFEM、PPM |
氣 體 | 空氣 | PPM 、PTFEM、MCEM |
真空泵排氣 | NylonM |
氣體及蒸汽過濾 | PVDFM、PTFEM |
高溫液體的過濾; | PVDFM、PTFEM |
壓縮空氣除菌過濾 | PVDFM、PTFEM |
